论文查重的时候一般来说是不需要提交参考文献的，除非你学校有要求。否则在后面参考文献那里标注出来，论文中什么地方用上了什么参考文献就好了

毕业论文查重时是需要提供一本完整的论文，格式为PDF版，所以当然要提交文献了，但是查重系统是不会查此部分的，但是参考文献格式一定要对。

审核中的论文，假如没有大的疑问，一般不会再查重。假如有发现抄袭嫌疑，当然还可能查重。